В письме от 30 декабря 2008 года ГНАУ разъясняет порядок взимания консолидированного налога с компаний, имеющих в своей структуре филиалы и другие обособленные подразделения, не имеющие статуса юридических лиц.
Так, согласно разъяснению, базирующемуся на подпункте 2.1.3 Закона "О налогообложении прибыли предприятий", налогоплательщик, имеющий филиалы, вправе принять решение об уплате консолидированного налога на прибыль и уплачивать налог в бюджеты по местонахождению филиалов, а также в бюджет территориальной общины по своему местонахождению, предварительно уменьшенный на сумму налога, уплаченного по местонахождению филиалов. О выборе консолидированного порядка уплаты налога юрлицо, создающее филиал(-ы), обязано сообщить в налоговую по своему местонахождению до 1 июля года, предшествующего тому, в котором будет уплачиваться налог. Это означает следующее. Если филиал был создан в 1-ом полугодии текущего года, то консолидированный налог может быть уплачен уже в первом квартале следующего календарного года. Если же филиал, скажем, создан во 2-ом полугодии 2008 года, то и консолидированный налог сможет быть уплачен лишь с 1-го января 2010 года. Тем не менее, если главный офис уже имеет свои филиалы и уплачивает консолидированный налог, при этом создает новый филиал, то данные этого филиала будут учитываться, начиная с того отчетного/налогового периода, когда они были созданы (подобное утверждение приводится в письме ГНАУ № 3335/6/12-0216 от 21 апреля 2005 г.). Налог на прибыль филиала рассчитывается юрлицом, его создавшим, в следующем порядке. Во-первых, рассчитывается общая сумма налога. Во-вторых, рассчитывается удельный вес суммы валовых расходов и амортизационных начислений филиала в общей сумме валовых расходов и амортизации юрлица. И, в-третьих, определяется сумма налоговых обязательств по налогу на прибыль филиала: общая сумма налога делится на показатель удельного веса и делится на 100 %. Что важно: филиалы также могут быть плательщиками авансовых взносов, перечисляемых в связи с выплатой дивидендов (официальная позиция ГНАУ).
Более подробный порядок уплаты консолидированного налога дано в Порядке составления расчета налоговых обязательств по уплате консолидированного налога на прибыль предприятий, утвержденном приказом ГНАУ № 68 от 10 февраля 2003 года.