мое мнение - любые попытки искать какие-то "ВД-ВР" у ФОП-единщика надо жестко пресекать в суде. Бухгалтерию он вести не обязан.
последнее время они пытаются представить дело так, что если не документов, подтверждающих расходы по приобретению товара, то значит тогда, он приобретался у физ.лиц, и значит тогда не был удержан с этого НДФЛ и т.п.
при проверке всё это надо жестко отрицать. помните, что у них нет и не может быть доказательств покупки и выплаты кому-то наличных денег. Не ФОП должен доказывать, что он не нарушал, а они должны доказать, что ФОП конкретно что-то нарушил. не идите у них на поводу и ничего по расходам не объясняйте.
в крайнем случае можно написать объяснение типа "приобретал у юрлиц, каких - не помню, документов не сохранилось, хранить их по закону не обязан". И ничего они с вами не сделают. В худшем случае будут просто тянуть проверку и ничего не делать....