Насколько помню, датой аннулирования будет считаться та дата, которую Вы укажете в заявлении.
По-поводу лицензии : если подсуетиться и до конца августа закинуть заяву в Департамент ( просим аннулировать лицензию....с 01.09.2013), то должны успеть.
По-поводу патента : начисления по патенту податковая делает до 15-го числа.Значит, если успеете написать заяву ( ...просим аннулировать патент с 01.09.2013) и занести ее до 15-го сентября, то за октябрь не надо будет платить. Думаю, что и оплату за сентябрь вернут.