Кики, когда идет вал документов, то такое часто бывает
Вам надо соорудить табличку, где будет привязка ГТД к инвойсам и к оплатам и по этой табличке работать с валютным контролем
просто один раз сядьте и сами разберитесь, а потом настаивайте, чтобы и банк вник
это ничем не чревато, потому что банк, если сам закрывает валютную задолженность, то никуда ничего не сообщает, т.е. они в собственных документах должны повести изменение и все
В критической ситуации вы не подниметесь до уровня своих ожиданий, а упадете до уровня своей подготовки (с)