Собственно вопрос:
Были заблокированы налоговые.
Отправили Додаток до Критеріїв.
Пришел ответ - Квитанция 2 - "Документ прийнято. Інформація з Таблиці даних платника податку врахована".

Что делать дальше? Ждать? Налоговые на данный момент так и незарегистрированы,

Документ прийнято. Інформація з Таблиці даних платника податку врахована - это говорит о том, что данные кода в таблице учтены и последующие налоговые накладные с этим кодом не будут блокироваться. К ранее заблокированным налоговым таблица не имеет никакого отношения, пока не подадите "Повiдомлення щодо подачi документiв про пiдтвердження реальностi здiйснення операцiй по вiдмовленим ПН/РК" к каждой заблокированной ранее НН/РК, потом ждете решение 5 рабочих дней, если повезет - налоговые разблокируют, нет - дальше оскарження, суд и т.д.