В 2017 году это была проблема, поскольку Минсоцполитики не удосужился ничего разьяснить.
Поэтому можна было остаивать 2 варианта.
ЗП + доплата и сверху индексация
или
ЗП + индексация и сверху доплата (если нужно)
Летом 2017 федерация профсоюзов добилась от Минсоцполити финального письма в котором говориться что нужно использовать ЗП + доплата и сверху индексация
Поскольку минималка это гарантированная оплата за отработанный месяц, а индексация это социальная доплата за инфляцию.
Поэтому в 2018 рекомендую не использовать индексацию как часть минимальной зарплаты. Можете попасть на приличные штрафы.