Нужно списать сумму предоплаты с 361сч,по поводу НДС- РК на уменьшение НО делать не будем, нам это непринципиально,поэтому примем точку зрения налоговой, но тогда как правильно списать? Допустим сумма 100 грн, тогда первая проводка 100 Дт 361 Кт 717 а вторая 16,67 Дт 944 Кт 643 или же надо сделать сторно? , что то я не пойму как правильно

У вас предоплата от покупателя? Вы счетами авансов 6811 и 3711 не пользуетесь?
Списываете:
ДТ361 КТ717 (719)
ДТ717 КТ6432
ДТ6432 КТ6412

если НО не корректируете, то последние 2 проводки не нужны