Я так поняла, под "регистрацией" Вы понимаете отражение в декларации. Попытайтесь использовать термины правильно, актов и прочего никто не регистрирует. Регистрируем мы только свои исходящие НН и минусовые РК от поставщика.
Теоретически в деке надо показывать безНДСные покупки, но фактически этого никто не делает, т.к. на результат в деке это не влияет. Соответственно за это ничего не будет по той же причине. Более того, даже за несвоевременное отражение в деке НН от поставщика ничего не будет. НК - это Ваше право, а не обязанность.