Сформували баланс, період закритий, визначили фінансові результати.
Сформували декларацію по прибутку, є податкові різниці, податок на прибуток на кілька тисяч більший до сплати ніж по балансу.

Що тоді, заново робити проводки по нарахуванню податку на прибуток, закривати період, визначати фінансові результати, формувати оновлений баланс? Звіряти оновлений баланс із декларацією і якщо потрібно то ідемо на друге коло?

В якому порядку це все потрібно робити?

На друге коло не треба, у Вас же фінансовий результат до оподаткування не змінюється, і різниці незмінні, від податку не залежать.
Я зазвичай спочатку формую фінрезультат без проводки по податку на прибуток, потім заповнюю декларацію, роблю проводку по податку и тільки потім остаточно формую баланс та фінрезультат. Інакше ніяк.