Друзья, как поступить? сотрудник был в командировке- жил в съемной квартире- естественно подтверждающих доков нет. Как лучше поступить- командировку оформить нужно, ездил на служебной машине, заправлялся в другом городе....

Ну нет и нет
может он в машине ночевал

Закриваєте авансовим звітом + наказ + посвідчення про відрядження (якщо ви цей документ практикуєте) + подорожній лист. Проживання - або не відшкодовуєте, або відшкодовуєте і з нього утримуєте ПДФО + ВЗ.

Дякую! т.е если нет подтверждающих документов на жилье, я могу возместить сотруднику деньги (заплатив налоги)? а с затратами- все ок?

Не можете, это ерунда. Давайте начнём платить вмесо зарплаты типа за жилье для командировки без документов. Чтоб ЕСВ не платить.