Отправляла 14 января на регистрацию НН штук 20 в одно время, по всем есть квитанции, а по ОДНОЙ глухо!!! в кабинете висит как отправленная, и тишина, даже нет первой квитанции...как быть?

Посмотрите в кабинете платника или сделайте вытяг за эту дату, если она зарегистрирована, то по вытягу втянется, если поставите крестик в нужной клеточке

нет ее нигде,...а работает правило, если нет квитанции в течении суток, то НН зарегистрирована по умолчанию?

если отправлю повторно сегодня (срок был 15) штрафов нет?

Не работает это правило. Оно бы работало, если бы уведомление о доставке приходило. Но они ж умные, уведомление вместе с квитанцией шлют, чтоб не прикопаться.
Штрафа за несвоевременную регистрацию нет, только покупатель не сможет в декабрьский НК включить.