Есть форма накладной, в которой вычерки не предусмотрены.
Эти каляки-маляки - фактически суть изменения условий договора, которые надо чем-то оформлять.
Просто не подписуйте отгрузку, пока они не сделают акт....
Когда я работала в торговле, у нас была своя форма накладной с актом приема-передачи, в котором были отдельные столбики для излишка и недостач. В случае разногласий люди просто заполняли акт и не морочили никому голову.
Вы не обязаны переделывать доки задним числом.
_______________
Корисна інформація для бухгалтера