Акт по услугам за прошлый квартал подписан и учтен сторонами. Потом оказалось, что услуги оказаны не в полном объеме, что стороны признают. Существует ли способ документально оформить уменьшение суммы акта кроме его замены задним числом?

Официально обоюдно делаете пересогласование сторон и расчет корректировки к НН. Пусть напишут вам письменно что услуги оказаны не в полном объеме и типа для обоюдного решения без привлечения судов просим вас внести изменения к акту ну и далее.

Пересогласование - это документ так называется?