//Теперь ему надо оформлять группу и надо чтобы больничные проходили по предприятию.//
А зачем? инвалидность присваивает медицинская комиссия на основании медицинских документов, какое им дело, оплачен больничный или нет? хотя, может это какое-то ноу-хау, раньше такого не было....
У нас в прошлом году болел сотрудник , приносил больничные, потом принес справку об инвалидности.
Дело в том, что ФСС будет проверять только больничные, если они есть, а справку об инвалидности будет смотреть ПФ.