Думаю, будет достаточно подать нову звитну (если сегодня успеете), с теми же строками, что и в первой новой звитной и с 1 в последней колонке. Без военного сбора.
Механизма нет, налоговики и сами не сразу видят. Наши, например, когда звонят по задвоению или ошибкам, говорят, что им из Киева инфу скидывают о несоответствиях. Разве что, послать кого-то из работников в налоговую за справкой о доходах, в ней будет видно, задвоилось или нет.