Попробуйте так:
1. "Перемещение малоценных активов в эксплуатации" заполняете по тому подразделению, по которому был ввод, только указываетет новое МВО, если нужно.
2. Создаете док-т "Партия малоценных активов в эксплуатации (ручной учет)" - в нем прописываете новое подразделение!.
3. Нажимаете на проводки по документу п. 1 "Перемещение малоценных активов в эксплуатации", включаете галочку "ручная корректировка" и правите субконто 3 - партия по Дт "МЦ".
Если сформируете ОСВ по МЦ с подразделением - то увидете как на одном ушло, в другое прибыло.