ФЛП плательщик НДС, с 12.06.13 принял человека на работу, начислена зп за июнь ставка 794,44.
Вопрос в книге учета доходов отражаем полную ставку за июнь, или только аванс-60 %

______________________________________________________________________________________
Править — бессмыленно, а управлять — мудро. Пра­вят, следовательно, потому, что не умеют управлять.

Надо понимать, Ваш ФОП на общей системе?
Ведь на самОй Книге написан порядок ведения!:
п.3.8
"У графі 9 відображаються витрати на оплату праці та нарахування на заробітну плату, понесені у звітному місяці."
Лично я в графе 9 Книги днем выплаты аванса/зарплаты показываю:
- сумму " на руки"
- уплаченный ПДФО
- уплаченный ЕСВ , начисленный и удержанный.