Вот кусочек бух.статьи из Лиги:
Відповідно до п. 129.1 ПКУ пеня нараховується, зокрема, в день настання строку погашення податкового зобов'язання, нарахованого контролюючим органом або платником податків у разі виявлення його заниження на суму такого заниження та за весь період заниження (в тому числі за період адміністративного та/або судового оскарження). Згідно з п. 129.4 ПКУ пеня нараховується із розрахунку 120 відсотків річних облікової ставки НБУ, що діє на день заниження.
При цьому, як зауважує ДПАУ в листі від 31.01.2011 р. № 2518/7/23-4017/89, оскільки нарахування пені закінчується в момент сплати податкового зобов’язання, при складанні актів перевірок в актах перевірок суми пені не нараховуються і не зазначаються.
Про обов'язок сплати платником податків сум пені зазначено у відповідних формах податкових повідомлень-рішень, які вручаються платнику під розписку.
Передбачається нарахування даної пені в автоматичному режимі та на підставі розрахунку податкового зобов'язання та штрафних (фінансових) санкцій.
Тобто, якщо у повідомленні-рішенні, яке надав платнику податку контролюючий орган за результатами перевірки, не буде нараховано пеню до сплати, це не означає, що сплачувати її не потрібно. В такому випадку платник податку повинен самостійно розрахувати її розмір та сплатити.