Я так понимаю, на 6811 была предоплата за услугу 1, выписана НН. На счете 361 оказание услуги 2, тоже выписана НН. В обоих случаях было два первых события. Если Вы перебрасываете предоплату в счет оплаты за уже оказанные услуги, нужно выписать расчет корректировки к НН, выписанной на предоплату, т.к. предоплата превращается в оплату за услугу 2, по которой уже было 1 событие. Вы этого не делаете, поэтому НДС и зависает. По счетам не подскажу, у меня 1С7.7, там другие субсчета по НДС. Вам нужно сторнировать проводку по НДС, которая прошла по предоплате (кт 641_НДС), возможно РК это сам сделает.