У меня ситуация та же, мы перевозчики, очень редко занимаемся экспедицией. Делаю так: 361 – 703 – 2000 грн сумма экс.вознаграждения
703 – 643 - 333,33 обязательсьва по НДС
377 – 685(631) - 8000 грн транзитные деньги
311 - 361 – 2000 получены деньги от Заказчика
В 1С провожу двумя платежками
311 – 377 - 8000 получены деньги от Заказчика
685(631) – 311 – 8000 перечислены деньги перевозчику.
При таком подходе в 1С использую вспомогательный счет 00 для отражения транзитных денег. Акт выполненных работ провожу после ручной корректировки.
Слышала, что еще экспедиторы используют счет 704 – вычет из доходов. Это кому как удобно. Не настаиваю на правильности своего варианта, но перебрав все возможные варианты – остановилась на этом. Выбор за Вами.