Если в договоре займа от фин. установы не указано что заимодатель - плательщик налога на общих основаниях , есть ли опасность что налоговая при проверке отнесёт суму займа ,которая не была возвращена на конец квартала, в состав дохода.И как вообще можно проверить статус контрагента.

Фин. установы не могут быть на едином налоге. Спите спокойно ))))