Если мы не находимся по юр. адресу, нужно ли ставить ГНИ письменно об этом известность?

Тогда это не может быть юр.адресом. Молчать об этом нужно.

Поняття «юридична адреса» та «фактична адреса» широко вживаються на практиці, проте законодавство містить лише поняття «місцезнаходження юридичної особи».

мой дир. настаивает чтобы я отнесла в гни письмо о том, что наш факт. адрес....
А вот и задумалась, стоит ли это делать?

Нет, не нужно этого делать.

а как убедить в этом директора?
Он уперся рогом, что нужно письмо такое накатать, что бы на нас в розыск не подали и усе.
А чем черевато если я отнесу это письмо?

письмо несите. если налоговая и будет направлять вам извещения о проверке и т.д. она всеравно будет на юридический направлять.
у них какое-то свое распоряжение есть, хоть ты тысячу раз им напиши фактический адрес. лучше в таком случае иметь почтовый ящик по юр.адресу.

Обязательно отнесите, если физ.адрес у вас легальный, т.е. с договором аренды.