Тополиво должно отпускаться по документам до поездки иначе это думаю можно рассматривать как частичную оплату оакзанной услуги топливом.
> Какое количество топлива отпускать (к примеру сколько литров дизеля опускать на 3000 км оказанных услуг по перевозке)?
Это как у вас в договоре напишите, а в акте выполненных работ на оказанные транспортные услуги впишите:
получено топливо от заказчика = ххххх л.
использовано согласно путевого листа исполнителя = ххххх л.
остаток топлива\перерасход = ххххх л.
остаток топлива возвращен заказчику\прерасход возмещен исполнителю
таким образом путевой лист внутренний документ исполнителя, а отношения между заказчиком оформленны в виде актов, если хотите перестраховаться, приложите к акту копию заверенную печатью исполнителя путевого листа (если мне не изменяет память расчет топлива есть и в ТТН а экземпляр ТТН идет и заказчику)