Судимся сейчас с налоговой по подобному вопросу. Возвращенные и списанные по гарантии, как не подлежащие ремонту товари разбирали и сдавали как лом, нержавейка понимаете ли, приемщики требовали от нас НН накладную без НДС с вписанной туда льготой. Теперь налоговая доказывает, что все, что получено при разборке как ОФ так и товаров есть тоже товар а не лом и облагается на общих основаниях. Требуют нас начислить налоговые обязательства. Хотя на момент когда данный вопрос возник они трактовали, что льгота есть. Юристы говорят, что отобъемся. Поживем увидим.
Касаемо вашего вопроса, то при ликвидации ОФ по решению налогоплательщика НДС начисляется на остаточную стоимость при ликвидации (если таковая есть) или не начисляется если при ликвидации вы предоставите налоговикам документы о том, что ОС пришло у негодность и не может быть использовано по назначению.
в вашем случае ликвидировать ОС не бывшие в эксплуатации прийдется начислить НДс не меньше, чем при покупке, будет лучше если вы его продадите, можно даже физ. лицу за какую-то небольшую стоимость, приказ руководителя, по поводу такой продажи с обоснованием цены лишним не будет.