А у Вас входящих "существенных" НН совсем не бывает?
У меня, конечно, суммы сравнительно небольшие, но в июле-августе как-то удалось проскочить с регистрацией НН без целенаправленного пополнения эл.счета. Просто, когда в конце июля перечислила на эл.счет сумму по июньской деке, пока она болталась на эл.счете до 29-30-го числа, удалось "под нее" зарегить все мне нужные НН. В связи с этим уже по июльской деке опять пришлось после сдачи декларации пополнять счет для уплаты НДС за июль, и под эту следующую сумму опять зарегила несколько НН. Но заметила, что они могут списать сумму в уплату по деке и раньше, поэтому в сентябре уже не спешила сразу после сдачи декларации закидывать недостающие деки на эл.счет, а подгадала под регистрацию очередной НН.
Но, конечно, не всегда все удачно совпадает. Вот в сентябре пошли косяком обязательства, и пришлось таки пополнять счет целенаправленно.