сейчас все по бух учету, и разниц по такой штуке нету, насколько припоминаю.
вот только чиновнику можно ли получать такой вид дохода?
я думаю у вас договор заключен с гос структурой о проведении экспертизы или что-то в этом духе, в договоре прописано что вы несете расходы по перевозке чиновника к производству и назад, но вот суточные ему не начисляла бы, он их получит у себя в гос структуре как и средний по командировке, а если вы выплатите суточные, то это доп благо и НДФЛ.
наверное, еще и перечисляете деньги по договору госструктуре за работы, вот оттуда он и получит свои суточные.