Как в конфигураторе разделить учет, чтобы вести 2 ФОПа? Спасибо.

Конфигуратор для этого не нужен.
Либо создаёте отдельную базу пустую (мне так удобнее), либо просто в справочнике "Фирмы" создаёте новый субъект хоз. деятельности ( то есть вашего ФОП-а), и тогда каждый раз при заполнения каких либо документов в 1С Вам нужно будет выбирать нужного ФОП-а (одного из двух).

Создаю новую фирму - ФОПа выскакивает уведомление о разделении учета именно в конфигурации, а там пересмотрела все и не нахожу.

По моему, все таки в конфигураторе разделитель учета должен быть включен для того, что бы по нескольким фирмам учет вести

Нашла инструкцию пошаговую, сейчас попробую.

конфигуратор-ПланыСчетов-Разделитель учета, ставим "НашиФирмы". Сохраняем.
После появляеся возможность добовлять фирмы.
И помним, что бэкапы только для слабаков