1. Зарегить НН.
2. Оплатить сумму штрафа на бюджетный счет и сумму уточнения в СЭА, если там остатка нет. Имеется в виду остаток живых денег, а не лимит.
3. Подать уточненку.
Пункты 1 и 2 можно поменять местами, подача уточненки всегда последняя. Обязательства с СЭА они сами спишут, но мне когда-то говорили, что нужно им позвонить и предупредить, чтоб не забыли снять. По факту и без звонка списывали, но через несколько дней и задним числом.