ИМХО, легче их подарить подрядчику и налогообложить. А компенсировать Заказчику каким-то другим способом. Но у Заказчика тогда тоже объект налогообложения возникает. Так что, наверное, не вариант.
Другой способ - через продажу. Т.е. сделать на бумаге возврат, и следом - на бумаге же - продажу. Но тут возникает вопрос списания их у подрядчика, раз физически их уже нет. Хотя этот вопрос так и так возникает.
Все вышесказзанное - ИМХО