Підкажіть будь ласка, контрагенту протягом декількох місяців виставлялись рахунки і він їх проплачував, відвантаження не було, або було частковим. По першій події, оплата, виписували податкові накладні. Відповідно по рахунках зависла передплата.
21/03/2019р. Зробили відвантаження по новому, не оплаченому рахунку, і відповідно по першій події виписали податкову.
25/03/2019р контрагент пише листа з проханням переплату згідно трьох рахунків зарахувати в оплату рахунку від 21/03/2019 і доплачує залишок заборгованості. На основі листа робимо коригування до трьох податкових накладних з "-" які були виписані по оплаті. Контрагент відмовляється реєструвати коригування, посилаючись на те, що лист це не підстава для коригування, і вважає, що при відвантаженні 25/03/2019 ми не повинні були відписувати податкову на всю суму, а лише на суму боргу і зробити коригування, до податкових на зміну номенклатури.
Допоможіть розрулити ситуацію. Дякую

Бухгалтера такі, казати вони можуть багато
Ви зробили правильно, по листу потрібно коригувати раніше зареєстровані ПН. Чи є лист достатньою підставою? А чому б і ні, якщо у нього наявні всі обовязкові реквізити. Були консультації від ДФС на цю тему, на швидку руку знайшов лиш [news.dtkt.ua]

Стосовно листа - подивіться договір, в якому може бути прописано, що листи (в т.ч. відправлені електронною поштою) рахуються додатками до договору або невід'ємними частинами договору або інше формулювання - для обгрунтування своєї позиції.
Якщо такого немає - домовлятись усно або навіть відправити офіційний лист з вимогою про реєстрацію коригувань з посиланням на норми ПКУ і нехай радиться зі своїм бухгалтером / аудитором.
Якщо це не дасть результату - рахувати в обліку окремо суми по Дебету (аванси) і Кредиту (відвантаження) - і вимагати від Покупця повну суму сплати по відвантаженню.
На все дбре

Дякую, будемо шукати рішення.

А в чому у них проблема зареєструвати коригування, якщо Ви на повну суму зареєстрували їм нову податкову? Ви ж зареєстрували? То може вони не розуміють принципа СЕА?

Так зареєстрували. Проблема в них в тому, що написаний ними лист вони не вважають підставою для коригування.

Вишли з ситуації таким чином:анулювали лист, вони оплатили не оплачений рахунок, а ми повернули кошти по предоплаті. і зробимо коригування на мінус датою повернення коштів