ФОП 3 группа с НДС получается как бы два учета. НДС по первому событию, единый налог по деньгам (нал, безнал и еще, читайте в кодексе)
В книгу заносится только доход, который облагается единым налогом. Кстати доход заносится без НДС, т.к. НДС не облагается единым.
Почитайте ПКУ, там не много и все доступно.
292.1. Доходом платника єдиного податку є:
1) для фізичної особи — підприємця — дохід, отриманий протягом податкового (звітного) періоду в грошовій формі (готівковій та/або безготівковій); матеріальній або нематеріальній формі, визначеній пунктом 292.3 цієї статті...