Не думаю, что за копейки будут штрафовать, тем более, что фактически их в обороте скоро не будет. Встречала этот вариант уже лет 10 назад на крупном заводе. Хотя, возможно крупные заводы штрафов не боятся. Кстати, тогда копейки были в ходу, поэтому вопрос с выплатой уволенным не стоял. Возможно скоро появятся какие-то разъяснения по копейкам в связи с их отменой.
Можно поступить иначе. Добавлять лишние копейки, а потом удерживать переплату в следующем месяце.