"..Только не юрлицо пишет такое письмо, а физлицо. Изменять назначение платежа может только тот кто делал оплату. .."
Ну так оплату-то и производило юрлицо, деньги-то его - т.е. юрлица, а физлицо просто выступило в данном случае "курьером", ему дали поручение перечислить деньги, а он это поручение выполнил неправильно.
Пусть тогда получатель д/с вернет эти средства ФЛ как ошибочно полученные, а предприятие повторно оплатит уже правильно