Скажите, правильно ли выписывать налоговую с точкой, т.е. номер налоговой накладной 680.1
????????????????

да без разницы, хоть точка, хоть дробь- главное что бы на этом предприятии была такая нумерация, и он эту же нумерацию указывал в своем реестре

3. Порядковий номер податкової накладної відповідає порядковому номеру реєстру отриманих та виданих податкових накладних.

При складанні податкової накладної філією чи структурним підрозділом платника податку порядковий номер податкової накладної встановлюється з урахуванням присвоєного коду (номера, шифру) і визначається числовим значенням через дріб. У чисельнику номера податкової накладної проставляється порядковий номер, а в знаменнику - код (номер, шифр).

(пункт 3 в редакції наказу Державної
 податкової адміністрації України від 08.10.98 р. N 469)