На предприятии есть должность водителя, а авто нету. это нормально?

а вы может в аренду авто брать будете?

уже 1,5 года не берем)

Может он на себе кого-нибудь возит?

Налоговая может при проверке снять с ВР, если будут смотреть штатное - нет связи с хоз.деятельностью.
Творчески могли бы увидеть еще что-то другое, но не думаю, что доказательств хватит

Тем более если штат не большой, то по-любому вычислят....