Все очень просто:
1. векселя выписываются только за уже поставленный товар ( оказанную услугу),
2. Если это простой беспроцентный вексель, тогда в налоговом учете не возникает ни ВР ни НК.
3. Если вексель процентный тогда необходимо чтобы поставщик товаров на которые был выписан вексель, выписал корректировочную налоговую, увеличивается НО у продавца на суму процентов, и увеличиваются ВД у продавца, а у покупателя ВР на суму процентов по векселю без НДС.