Какие могут быть последствия если предприятие не находится по юр.адресу.

1. непринятие отчетности в налоговой.
2. ликвидация св-ва плат-ка НДС.
3. ликвидация предприятия.

Т.е важно находится по юр.адресу обязательно или можно где то указыват фактический адрес

У меня точно такая же ситуация, я подала копии договоров на оренду фактичекого и юридического в налоговую и написала письмо в налоговую, и в отчётах я указываю факт и юрид. адресс то пока у них притензий нет. Советую и вам так сделать.

А если юридический адрес - это частный дом учредителя, то договор аренды все равно нужно заключать?

Договор не нужен, т.к. это его жилье.