У меня тоже сплошные вопросы на эту тему.
Про подпись врача - говорят, обязательно. Насчет обоснования - читала в нескольких темах на форуме "ЛИГА" (Бухгалтерские посиделки и Автофорум). На практике люди заключают или договор с врачом, имеющим спец.печать для путевых листов, или договор с автотрансп.предприятием на услуги их врача.
По поводу списания бензина при разных условиях поездки - по идее, в путевом ставится факт.расход (можно приблизительно этот факт.расход прикинуть исходя из остатка на начало и конец дня и заправленного в течение дня), и тут же этот факт.расход сравнивается с нормой (согл. Нормам, утв.приказом № 43 или утв. приказом директора (если вашей модели автомобиля нет в Нормах № 43)).
У меня тоже автомобиль ездит в командировки, но, естественно, сколько машина ехала в условиях города, а сколько по трассе, я узнать не могу. Поэтому ориентируюсь на среднюю норму, установленную и на предприятии при определении факт.расхода.