Предприятие А переуступило часть в уставном фонде Предприятию Б на безоплатной основе. Является ли это доходом и базой для налогообложения прибылью у Предприятия Б.

Да - на часть, указанную в уставе предприятия, чьи корправа переуступили. Сделайте лучше за 5грн куплю-продажу, чем безоплатно - тогда это будет договорная цена и никто не придерется.