Перевезення по Україні але під таможенним контролем ПДВ - 0% ?

если оформлялся единый транспортный документ (СМР при авто), то 0%....т.е. не должно быть ТТН

Стаття 195. Операції, що підлягають оподаткуванню за нульовою ставкою
195.1.3. постачання таких послуг:
а) міжнародні перевезення пасажирів і багажу та вантажів залізничним, автомобільним, морським і річковим та авіаційним транспортом.
Для цілей цього підпункту перевезення вважається міжнародним, якщо таке перевезення здійснюється за єдиним міжнародним перевізним документом;

Так и есть СМР я им это цитировала , но заказчик утверждает,что только если перевозка из-за границы тогда 0% ,а так раз по Украине то с НДС , кроме того им все перевозчики оформляют с НДС.

у Вас перевозка одним транспортом? Если море - коносамент, например Одесса 0%, далее авто Одесса-Киев по Украине - оформлется СМР (под тамож. контр, растаможкка Киев) - этот участок уже 20 % ...