Пришлось заплатить за услуги за другую компанию, поскольку у них нет сейчас денег.Позже они нам компенсируют расходы.Вопрос в том, как это оформить правильно и не попасть с НДС.Услуги эти были без НДС.
Как правильно оформить акт на компенсацию,чтобы налоговая это не трактовала так,что мы услуги оказали кому-то и НДС на эту сумму не насчитала?

Ну это Вы придумали. Платить за кого-то нельзя. Какой акт на компенсацию? Мог бы быть договор комиссии на покупку услуги, но это уже ушло, у вас формулировки платежей уже есть.

Попробуйте закрыть векселями, они без НДС, только там нужен торговец ЦБ, задним числом может не получиться.

Еще вариант - договор перевода долга.

Задним числом можно только перевод долга сделать. Кто же это вексель задним числом выпишет, если у среднестатистической компании бланков векселей нет!

Спасибо за совет.Но никогда не сталкивалась с переводом долга.Как он оформляется?

Оформляется договором. Поищите в яндексе или гугле

Почитала о договоре перевода долга и не пойму,как это к нашей ситуации применить,тем более задним числом.Задним числом долга никакого не было.Мы ( предприятие А) сегодня сделали предоплату предприятию С за обучение сотрудника другого предприятия (предприятие Б).И только сегодня появился долг между нами и предприятием С, пока услуги не будут оказаны.Но услуги будут оказаны не нам.И тогда возникнет задолженность между нами и предприятием Б.Как тут можно задним числом менять должников я что-то не пойму.

А может договор поручения Типа компания А поручает компании Б заплатить за услуги такие-то и обязывается компенсировать Типа так

Очень редко, но встречается на практике 3-сторонний договор. Плательщик и получатель - разные стороны, но при этом описано еще, чем они друг другу компенсируют.

Правильнее делать не договор перевода долга, а договор поручительства, т.к. о том, что платить будет другое юр.лицо (насколько я понял) было известно заранее еще до возникновения долга.
Поручитель оплатит, а должник потом обязан ему возместить затраты.