В "Операции" отборы по группе деятельности жёстко прописаны.
Попробуйте, может Вам подойдёт этот вариант:
1) сделать документ "Перемещение товаров" в разделе Склад. Документ даст выбрать только "Оподатк. ПДВ". Проводите его.
2) делаете "ручную корректировку регистров" - это галка в проводках по документу. И там где у Вас "Оподатк. ПДВ" нажимаете "х" и можно выбрать группу "до 2011", а дальше "(не исп.) Торг. д-сть (пат.), не обл. НДС".