Естественно, что при необходимости восстановить РК, ее нужно восстанавливать на другом Медке.
Лучше всего конечно поудалять ненужные отчеты, если они еще не были отправлены. Почитстить Корзину в реестре первичных документов.
П.С. поставьте флажок в настройках при создании резкопии "Сохранять последние Х копий" (например, 5 шт). И они всегда будут актуальными. Остальных не будет, это позволит экономить место на резкопиях.