нужно посмотреть как в уставе описан процесс принятия решения участниками, какой проходной % голосов.
Я бы так делала:
1. собрание учредителей, проголосовали и 70% голосов приняли решение уволить директора и назначить нового. Собрание проведите по всем правилам, с обязательным уведомлением через почту ценным письмом всех участников о том что будет собрание.
2. подаете документы (решение учредителя) гос регистратору. Если нотариально не заверяете, то учредитель должен будет явится лично с паспортом и протоколом. Не забывайте заполнить соответствующую карточку.
3. дальше учредитель - директор будет уволен, а новый приступит к своим обязанностям.
бывший директор может подать в суд конечно и вам придется дальше с ним возится.
по поводу исключения из учредителей тоже нужно устав читать, возможно то что он не сделал взноса и будет являться основанием для исключения.