Вот как мы делали (смена состава учредителей, изменение размера устава)
Протокол о решении учредителей о выходе одних и вкл. других учредителей
Заявление у нотариуса учредителей, которые выходят из состава учредителей о переуступке прав учредитлям, которые входят в состав
Новая редакция устава
Заявление к госрегистратору
Регситрация у нотариуса новой редакции устава
А дальше, копию (нотар. завер) в банк, в налоговую (+заявление), ну и все инстанции пройти, где нужно будет подать новые документы